La majorité des heures de cours sont consacrées au programme obligatoire. Les matières sont les mêmes pour tout le système mais chaque école peut choisir parmi les sujets d'étude et le matériel éducatif fournis par le ministère de l'Education ce qui convient le mieux à son corps enseignant et à ses élèves.

Afin d'améliorer la connaissance de la société environnante, un thème d'importance nationale fait l'objet, chaque année, d'une étude approfondie. Parmi les divers thèmes choisis jusqu'ici, citons : les valeurs démocratiques, la langue hébraï¬que, l'immigration, Jérusalem, la paix et l'industrie.

La majorité des écoles secondaires dispensent des programmes en sciences et humanités sanctionnés par un diplôme d'études secondaires (bagrout) permettant la poursuite d'études supérieures. Certaines d'entre elles proposent des programmes spécialisés s'achevant par un diplôme d'aptitude professionnelle.

Les écoles technologiques forment des techniciens à trois niveaux d'orientation : les uns se préparent à des études supérieures, d'autres ont pour objectif un diplôme professionnel ou une formation technique.

Les écoles agricoles, généralement en internat, ajoutent aux programmes de base des éléments d'agronomie.

Les écoles de préparation militaire assurent la formation des personnels et des techniciens militaires dans les domaines spécifiques requis par les Forces de défense d'Israël. 

Les lycées-yéshiva, en internats distincts pour garçons et filles, complètent les programmes d'études générales par des études religieuses intensives et accordent une place importante au respect de la  tradition et du mode de vie juifs.

Des établissements spécialisés dispensent diverses formations professionnelles allant de la comptabilité à la mécanique, l'électronique, les métiers du tourisme, le graphisme et bien d'autres.

Le ministère de l'Education est chargé des programmes, des normes éducationnelles, de la supervision  du personnel enseignant et de la construction des établissements scolaires. Les autorités locales sont responsables de l'entretien des locaux et de l'acquisition des équipements et des fournitures. Les enseignants des jardins d'enfants et des écoles primaires sont des fonctionnaires du ministère, tandis que ceux des classes supérieures sont employés par les autorités locales qui reçoivent des allocations proportionnelles à l'importance de leur population scolaire. Le gouvernement et les autorités locales financent 80% du budget de l'éducation, le reste provenant d'autres sources.

La Télévision scolaire, dépendant du ministère de l'Education, produit et diffuse des programmes éducatifs suivis dans les salles de classe, ainsi que des émissions destinées à toute la population du pays. Elle collabore en outre avec des spécialistes de pédagogie des universités et des écoles normales pour la conception de méthodes didactiques.

Destinée aux jeunes comme aux adultes, la Télévision scolaire assure leur formation continue par le biais d'émissions d'enrichissement culturel et d'informations pour enfants, adolescents et adultes.

Les enfants surdoués, classés parmi les 3 % des meilleurs élèves de leurs classes et ayant été soumis à des tests d'aptitude, participent à des programmes particuliers dans des écoles spéciales à plein temps ou à des activités extra-scolaires spécialement conçues pour eux. Les classes pour surdoués sont caractérisées par le niveau des élèves et de leurs études ; l'accent y est mis non seulement sur l'acquisition de connaissances et la compréhension, mais aussi sur l'application à d'autres disciplines des concepts acquis. Les élèves apprennent à faire de la recherche et à traiter la documentation de façon indépendante.

Afin de leur assurer la meilleure intégration possible dans la vie sociale et professionnelle, les enfants handicapés physiquement, mentalement ou en difficulté scolaire sont placés dans les cadres adéquats, en fonction de la nature de leur handicap. Tout est fait pour garantir leur insertion sociale et communautaire. Certains sont accueillis dans des établissements spéciaux tandis que d'autres suivent les cours des écoles régulières où ils bénéficient de cours d'appoint  et de cours particuliers.

La responsabilité des programmes est assumée par des spécialistes des problèmes de santé, des psychologues, des travailleurs sociaux et des éducateurs ayant reçu une formation particulière, avec la participation des parents et des services de soutien communautaires. Une commission établie par la loi et nommée par le ministère de l'Education décide de l'admission de jeunes handicapés de 3 à 21 ans dans les établissements d'éducation spéciale.